Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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