Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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