Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms