Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTRK2Q16620 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms