Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CTF1Q16619 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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