Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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