Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms