Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNAPC1Q16533 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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