Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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