Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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