Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNGA3Q16281 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CNGA3Q16281 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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