Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKIV2LQ15477 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms