Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOMM20Q15388 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms