Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
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EEA1Q15075 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EEA1Q15075 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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