Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIN2CQ14957 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms