Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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