Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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