Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A3Q14050 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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