Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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COL4A6Q14031 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms