Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms