Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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