Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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