Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TUBA3CQ13748 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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