Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKBH1Q13686 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms