Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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