Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms