Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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