Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLFQ13129 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RLFQ13129 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RLFQ13129 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RLFQ13129 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RLFQ13129 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RLFQ13129 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RLFQ13129 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RLFQ13129 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RLFQ13129 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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