Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LCP2Q13094 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LCP2Q13094 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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