Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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