Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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