Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms