Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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