Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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LMAN2Q12907 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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