Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms