Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms