Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms