Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms