Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD51Q06609 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms