Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL606490.5-201ENST00000413071 760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL391152.1-201ENST00000554160 1111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC013400.1-201ENST00000607190 545 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms