Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms