Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms