Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms