Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAT1AQ00266 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms