Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3AP98173 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3AP98173 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms