Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX1P83916 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX1P83916 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX1P83916 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX1P83916 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms