Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRB1P82279 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB1P82279 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB1P82279 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB1P82279 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms