Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAE1P78406 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms