Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms