Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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